دانش‌آموختگان به عنوان بخش عظیم سرمایه‌های انسانی كشور می‌توانند در امر توسعه مشاغل جدید و نوسازی بسیاری از مشاغل سنتی و كم‌بازده پیشگام باشند. جهاد دانشگاهی با توجه به اهمیت این گروه خاص و به پشتوانه‌ی انگیزه و شناخت خود از فرآیندهای مرتبط با اشتغال نظیر آموزش، فرهنگ‌سازی، توسعه محصولات و فرایندهای جدید و اجرای طرح‌های اقتصادی و صنعتی به منظور حضور موثر در عرصه اشتغال، طی گام‌های زیر پا به عرصه اشتغال دانش‌آموختگان نهاد.

• تشکیل ستاد اشتغال در سال ۱۳۷۷ با هدف آغاز بررسی‌های اولیه و عمومی اشتغال دانش‌آموختگان
• اضافه‌شدن وظیفه «مشاركت در ایجاد زمینه‌های مناسب برای اشتغال دانش‌آموختگان» به اساسنامه جهاددانشگاهی در جلسه مورخ 1379/10/13 شورای عالی انقلاب فرهنگی و تأسیس سازمان همیاری اشتغال دانش‌آموختگان
• تاسیس شعب و مراكز وابسته به سازمان در استانها و واحدهای جهاد دانشگاهی از سال ۱۳۸۳
• افزودن مأموریت جدیدی به وظیفه قبلی سازمان مبنی بر تسهیل تجاری‌سازی فناوری در پارك‌ها و مراكز رشد علم و فناوری و انتقال فناوری‌های به بلوغ رسیده به شركت‌ها و مؤسسات جهت تحقق اهداف سند چشم‌انداز و برنامه‌های توسعه مطابق با جلسه هیات امنای مورخ 1393/7/9 و تغییر نام سازمان به سازمان تجاری‌سازی فناوری و اشتغال دانش‌آموختگان

این سازمان در سال 1398همگام و هم‌راستا با تغییرات ساختاری و تشکیلاتی دفتر مرکزی جهاددانشگاهی، درصدد تغییرات ساختاری متناسب با نیاز روز بازار برآمد. ماحصل تغییرات مطابق با جلسه هیات امنای مورخ 1398/3/12 راه‌اندازی ۳ معاونت تخصصی «کارآفرینی و توانمندسازی» ، «مطالعات و تحقیقات كاربردی» و «اطلاع رسانی بازار كار» بود.
سازمان‌ها برای ادامه حیات خود نیازمند همگامی مستمر در برابر تغییرات محیطی هستند. به همین منظور و به جهت پویا نمودن حوزه اشتغال جهاددانشگاهی و همچنین متمركز شدن فعالیت‌های دیگر این حوزه كه در قالب: مراكز رشد فناوری، پارک‌های علم و فناوری،هفته نامه بازار كار و مركز اطلاع رسانی بازار در بخش‌های دیگر جهاد دانشگاهی مشغول فعالیت بودند از یك سو و از سوی دیگر فراهم نمودن زمینه‌ای جهت تجاری‌سازی طرح‌های پژوهشی به بلوغ رسیده متعدد، و در نتیجه فراهم نمودن فرصت‌های شغلی جدید، تصمیم بر آن شد كه كلیه برنامه‌ها و خدمات حوزه اشتغال و کارآفرینی جهاد دانشگاهی در یك ساختار منسجم سازمانی و با یك حوزه سیاست‌گذاری، برنامه ریزی و نظارتی واحد، تجمیع شود.
با این اقدام یك بخش نیرومند و كارآمد مدیریتی ايجاد شده و با هم افزایی درون سازمانی و اهداف مشترك، برنامه‌های اشتغال دانش‌آموختگان و نوآوری و تجاری‌سازی فناوری با قوت بیشتر مسیر خود را طی مي‌نماید. در همین راستا و به منظور نقش‌آفرینی بیشتر در زیست‌بوم اقتصاد دانش‌بنیان کشور با تغيير اساسنامه مطابق مصوبه 1399/4/18 هيأت امناي جهاد دانشگاهي نام سازمان به سازمان تجاري‌سازي فناوري و اقتصاد دانش‌بنیان تغییر و مأموریت‌های جدید به سازمان محول و بخشی از وظایف آن در خصوص مشاغل خانگی از سازمان منفک گردید.